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Linux环境中R语言绘图问题
## R语言绘图的时候，导出到png文件报错 `Rscript plotCNVforWES.R /data/CNV_vcf/16/10354.cnvall.txt 10354 chr8 101199347 103424492 1 hg19` **报错信息：** ``` Error in .External2(C_X11, paste0("png::", filename), g$width, g$height, : unable to start device PNG Calls: png In addition: Warning message: In png(outname, width = 1800, height = 300, units = "px") : unable to open connection to X11 display '' Execution halted ``` **解决方案：** 错误信息表明R无法启动PNG设备来生成PNG文件，因为它无法连接到X11显示。这通常发生在Linux服务器上，因为它没有可用的X11显示。为了解决这个问题，你可以使用不依赖于X11显示的方式生成PNG文件。你可以使用Cairo包来绘制图形并将其保存为PNG文件。如下： ``` # 安装和加载Cairo包 install.packages("Cairo") library(Cairo) # 开启Cairo绘图设备 CairoPNG("output.png", width = 800, height = 600) # 绘制你的图形 plot(1:10, 1:10, type = "l") # 关闭Cairo绘图设备 dev.off() ``` > 安装Cairo报错：configure: error: Cannot find cairo.h! Please install cairo `sudo apt-get install libcairo2-dev`
laihui126
2024年1月23日 16:54
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