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conda构建虚拟环境
安装conda 配置 配置文件~/.condarc文件内容如下： channels: - defaults show_channel_urls: true default_channel_urls: - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.……
laihui126 - 2024年12月27日 08:53
R源码安装常见报错及更换package安装源
R语言安装及常见报错 20240731 提示x86_64-conda-linux-gnu-cc not found 方法来源 1. 类似如下提示未找到x86_64-conda-linux-gnu-cc 2. 根据提示找到R所在lib的路径文件/path/to/lib/R/etc/Makeconf中的第 171 行代码。 3. 变量CC，在前面已经声明 4. 将变量CC的值修改为x86_64-……
laihui126 - 2024年7月31日 09:38
karyoploteR基因组数据可视化
2023-07-19 10:59:17 星期三 karyoploteR介绍 ikaryoploteR is an R package to create karyoplots, that is, representations of whole genomes with arbitrary data plotted on them. It is inspired by the R base gr……
laihui126 - 2024年7月31日 09:27
【实用】Bioconductor的正确使用
Bioconductor 软件仓库 项目简介 Bioconductor 为高通量基因组数据的分析和可视化提供开源工具。Bioconductor 多数软件包采用 R 统计编程语言开发。Bioconductor 每年释出两个版本，并有活跃的用户社区。 【清华大学开源软件镜像站】 使用方法 Bioconductor 镜像源配置文件之一是 .Rprofile（linux 下位于 ~/.Rprofile, ……
laihui126 - 2024年7月30日 10:52
Linux环境中R语言绘图问题
R语言绘图的时候，导出到png文件报错 Rscript plotCNVforWES.R /data/CNV_vcf/16/10354.cnvall.txt 10354 chr8 101199347 103424492 1 hg19 报错信息： Error in .External2(C_X11, paste0("png::", filename), g$width, g$height, : ……
laihui126 - 2024年1月23日 16:54
